دوره 18، شماره 2 - ( علوم پیراپزشکی و بهداشت نظامی ( تابستان 1402) 1402 )
جلد 18 شماره 2 صفحات 14-8 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Jalili S, Sarvari J, Hashemi S M A. Variation and Phylogenetic Analysis of the ORF9b Genes of SARS-CoV-2 Isolated from Iran. Paramedical Sciences and Military Health 2023; 18 (2) :8-14
URL: http://jps.ajaums.ac.ir/article-1-379-fa.html
URL: http://jps.ajaums.ac.ir/article-1-379-fa.html
جلیلی شیرین، سروری جمال، هاشمی سید محمد علی. بررسی تغییرات فیلوژنتیکی در ژن ORF9b ویروس های SARS-CoV-2 جداسازی شده در ایران. علوم پیراپزشکی و بهداشت نظامی. 1402; 18 (2) :8-14
1- پژوهشگاه علوم انتظامی و مطالعات اجتماعی، پژوهشکده تجهیزات و فناوری های انتظامی، تهران، ایران ، jalili.shirin@yahoo.com
2- گروه باکتری شناسی و ویروس شناسی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
3- مرکز تحقیقات گوارش و کبد، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
2- گروه باکتری شناسی و ویروس شناسی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
3- مرکز تحقیقات گوارش و کبد، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
چکیده: (931 مشاهده)
مقدمه: پروتئین ORF9b که یک پروتئین جانبی ویروس سارس-2 (SARS-CoV-2) می باشد از طریق مکانیسم هایی می تواند در بیماری زایی ویروس نقش داشته باشد. جهش در این ناحیه ژنی کد کننده می تواند بر عملکرد پروتئین و شدت بیماری اثر بگذارد. بنابراین در این مطالعه به بررسی جهش ها در ژن ORF9b ویروس های سارس-2 جداسازی در ایران می پردازیم.
مواد و روش ها: توالی های ORF9b مربوط به ویروس های سارس-2 جداسازی شده در ایران که در پایگاه اطلاعاتی مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری (National Center for Biotechnology Information) یا به اختصار NCBI ثبت شده بودند و همچنین توالی ORF9b سویه ووهان به عنوان سویه مرجع استخراج گردید. تغییرات اسید آمینه ای بررسی و همچنین درخت فیلوژنتیکی توالی های استخراج شده با سویه مرجع ووهان با استفاده از نرم افزار مگا ورژن 7 و روش نیبرجوینینگ رسم گردید.
یافته‌ها: در نهایت تعداد 24 توالی کامل ژنوم ویروس سارس -2 از NCBI استخراج گردید. بررسی در سطح اسید آمینه نشان داد که ORF9b مربوط به ویروس هایی که به تازگی جداسازی شده‌اند نسبت به سویه مرجع ووهان دچار تغییراتی شده اند. 3 تا از این تغییرات، در ناحیه اتصال این پروتئین به(TOM70) Translocase Of Outer Mitochondrial Membrane 70 بود. همچنین رسم درخت فیلوژنتیکی نشان داد با گذر زمان در سویه های جداسازی شده، ژن ORF9b ویروس سارس-2 متفاوت تر شده است.
بحث و نتیجه‌گیری: با توجه به نقشی که پروتئین ORF9b در پاتوژنز سارس-2 دارد و جهش هایی که در این پروتئین رخ می دهد، پیشنهاد می شود تغییرات در این پروتئین ویروسی در انواع جدیدی که شناسایی شده اند، پایش شود.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
مقالات کامل
دریافت: 1402/6/16 | پذیرش: 1402/8/30 | انتشار: 1402/11/10
دریافت: 1402/6/16 | پذیرش: 1402/8/30 | انتشار: 1402/11/10
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
